Στη Χίο ο Μάρκος προσευχήθηκε με κατάνυξη, κοινώνησε των αχράντων μυστηρίων και προχώρησε με θάρρος στο κριτήριο της πόλης.

Μπροστά στον κριτή κήρυξε ανοιχτά τη χριστιανική του πίστη και απέρριψε όλες τις κολακείες και τις υποσχέσεις που του έγιναν.

Τότε τον έριξαν στη φυλακή, όπου υπέστη σκληρά και ανελέητα βασανιστήρια από τους δεσμοφύλακες με πολλή αγριότητα.

Όταν τον οδήγησαν για δεύτερη φορά μπροστά στον κριτή, ο Μάρκος ομολόγησε και πάλι σταθερά το όνομα του Χριστού.

Οι Τούρκοι εξαγριώθηκαν, τον γκρέμισαν από τις σκάλες και τον έκλεισαν ξανά στη φυλακή με ακόμα πιο φρικτά μαρτύρια.

Όμως ο μάρτυρας δεν γόγγυζε καθόλου, αλλά έψαλλε ύμνους με χαρά και ευχαριστούσε διαρκώς τον Θεό.

Όταν οι χριστιανοί της Χίου έμαθαν την υπομονή και τη γενναιότητά του, άρχισαν να νηστεύουν και να προσεύχονται θερμά.

Αφού κοινώνησε ξανά μέσα στη φυλακή, στάθηκε για τρίτη φορά μπροστά στον κριτή και ομολόγησε με παρρησία τον Χριστό.

Τελικά τον οδήγησαν στον τόπο της εκτέλεσης και τον αποκεφάλισαν ημέρα Τετάρτη, στις δύο τα ξημερώματα.

Οι χριστιανοί της Χίου έψαλλαν τότε ύμνους ευχαριστήριους στον Θεό για τη λαμπρή νίκη του νεομάρτυρα Μάρκου.